با توجه به عملکرد بسیار خوب دبیرستان علامه طباطبایی واحد کارگر شمالی و کسب رضایتمندی دانش آموزان و اولیا و همچنین استقبال زیاد برای ثبت نام در آن دبیرستان هیات مؤسس به منظور پاسخگویی به درخواست و مطالبۀ خانوادهای محترم دبیرستان دورۀ دوم علامه طباطبایی واحد دکتر فاطمی را در نزدیکی دبیرستان واحد کارگر شمالی در سال ۱۳۷۹ تأسیس نمود.

این دو واحد آموزشی با لحاظ نمودن سابقه ی فعالیت و همچنین نزدیکی موقعیت مکانی این فرصت را ایجاد کرده‌اند تا با برنامه های آموزشی تدوین شدۀ مشترک (کادر آموزشی یکسان، آزمون‌های مشترک و دیگر فعالیتهای علمی) سال‌های متمادی موفق به کسب رتبه های برتر کنکور سراسری شوند. این واحد آموزشی در راستای اهداف والای مجتمع علامه طباطبایی با مهیا نمودن امکانات مناسب فرهنگی آموزشی و تربیتی توانسته است با ایجاد امکان استفاده از سالنهای ورزشی استاندارد نزدیک به مدرسه و فراهم کردن فضاهای متمرکز مطالعاتی موفق باشد.

ضمن اینکه همۀ واحدهای آموزشی مجتمع علامه طباطبایی از امکانات بی نظیر ساختمان مرکزی آن مجتمع در منطقه پنج مانند سالن‌های ورزشی چند منظوره سالن‌های متعدد و استاندارد جهت برگزاری اردوهای مطالعاتی سالن همایش‌ها جهت جمع‌بندی دروس و مباحث روانشناسی و آزمایشگاه‌های تخصصی و کارگاه‌های پژوهشی برخوردار هستند.